El microscopio biológico puede tener una testa monocular o binocular. Está caracterizado por un elevado poder de aumento y se utiliza para observar muestras preparadas, órganos o secciones de tejidos, sobre una superficie de vidrio iluminada. Este tipo de microscopio está dotado de una fuente de luz incidente, que proviene desde abajo, o un espejo para concentrar la luz solar. El microscopio estereoscópico, al contrario, es siempre binocular y ofrece una visión tridimensional. Tiene un bajo poder de aumento, así que se emplea para observar cuerpos sólidos y opacos, como minerales, vegetales, insectos etc.

Antes de comprar un microscopio es importante acordarse las siguientes características:
- AUMENTO: el producto entre el aumento del ocular y el aumento del objetivo, es el poder de aumento total. Al crecer del aumento disminuye el campo visible. 
- ILUMINACIÓN: puede ser a luz incidente, o bien desde abajo y particularmente útil en los MICROSCOPIOS biológicos, o luz transmitida, desde arriba, más útil para los MICROSCOPIOS estereoscópicos. Algunos modelos de estereoscopios llevan ambas iluminaciones.

Según la necesidad del cliente, para disminuir o aumentar el aumento proporcionado, podría ser necesario comprar a parte oculares y/o objetivos. En un microscopio biológico, cuando no está incluida, puede ser útil una pequeña platina para trasladar (un instrumento cuadrado que permite muy pequeños movimientos del plano de vidrio) y una luz para proporcionar la necesaria iluminación para la observación de las muestras preparadas. Puede ser además útil un especial ocular micrométrico graduado para medir con precisión las dimensiones de lo que ha sido preparado.

Sí, pero es necesario tener dos adaptadores: un adaptador foto para un determinado microscopio, y el anillo T-2 para la propia marca de reflex. Para un microscopio binocular se engancha la cámara a uno de los oculares.